见康华美研究成果-中国急性髓系白血病患者专属的MRD检测方案

       近日，见康华美在“International Journal of Laboratory Hematology”杂志发表题为“An NGS based MRD evaluation from acute myeloid leukemia patients”的文章。本研究针对中国急性髓系白血病 (AML) 患者设计了MRD监测方案，该panel以其较小的覆盖范围同时又能够检测更多AML患者的MRD为特色，兼顾了检测经济性和检测能力，对于开展AML患者NGS MRD相关研究及临床应用具有重要价值。

MRD已被常规用于AML患者的预后评估和指导治疗。NGS方法因其更广泛的适用范围、更高的灵敏度及追踪克隆演变的能力，逐渐成为MRD监测的新宠¹。随着唯一分子标签 (UMIs) 和错误校正技术等新技术的发展，NGS能够检测到低至0.1~0.05% VAF的白血病克隆²，但同时相应的测序深度需要10,000x以上，测序成本高，因此一个适宜的panel是NGS MRD临床应用的关键。

   本研究纳入了1003例初诊和治疗后AML患者的NGS数据，基因突变图谱（图1）显示中国人群AML患者的NPM1和FLT3-ITD突变发生率要低于西方患者，然而KRAS突变发生率却更高。

图1： AML患者体细胞突变图谱

      本研究同时将目前文献报道的几款NGS-MRD panel在中国AML患者中进行验证，结果显示：小panel（如22/23/28基因的panel）虽然测序成本低但能够覆盖的患者数量仅约80%；大panel虽然能够覆盖较多的患者但测序成本指数增加（图2）。

图2：不同文献使用的panel在中国人群中的验证结果

本研究最终筛选了52个基因的178个外显子组成“AML NGS-MRD热点panel”，该panel总覆盖范围仅为62.8Kb，却能够应用于92%的AML患者的MRD检测，且多个验证集的验证均有很高的检测能力（图3）。

图3：使用训练集及不同的验证集对panel检测能力的验证结果

该“AML NGS-MRD热点panel”解决了临床进行AML患者NGS MRD监测的痛点：覆盖广度和测序深度的平衡，相信该panel能够获得理想的临床实验结果。

见康华美不仅开展AML MRD检测，同时开展Ig/TCR基因重排NGS MRD检测、白血病及淋巴瘤ctDNA定制化监测等项目，能够满足临床多元化的需求。

作者简介：

      陈斌，见康华美实验室研发部主管。从事血液肿瘤/实体肿瘤分子检测项目研发工作8年，已开发几十种肿瘤分子检测项目，检测项目已服务于万余名患者。

1            Ciurea, S. O., Kothari, A., Sana, S. & Al Malki, M. M. The mythological chimera and new era of relapse prediction post-transplant. Blood Rev 57, 100997, doi:10.1016/j.blre.2022.100997 (2023).

2            Balagopal, V. et al. Measurable residual disease monitoring for patients with acute myeloid leukemia following hematopoietic cell transplantation using error corrected hybrid capture next generation sequencing. PLoS One 14, e0224097, doi:10.1371/journal.pone.0224097 (2019).